地球突遭名为“龙”的神秘生物侵袭，人类濒临灭亡。与此同时，一部分少女觉醒为拥有对抗龙之力的异能者“D”，她们被集中到隔离学院“密得加尔特”。少年物部悠是罕见的男性“D”，他被秘密派遣至此，负责监视并保护最重要的“D”——伊莉丝·弗蕾亚。在这个只有少女的学园里，物部悠的到来打破了平衡。他不仅要隐藏自己的真实身份与任务，还必须与妹妹物部深月以及性格各异的“D”少女们共同生活、训练。随着与龙的战斗日益激烈，少女们自身的秘密与“龙化”的危机也逐渐浮现。物部悠被迫在任务与情感间做出抉择，直面“D”之力的残酷真相。故事围绕着战斗、羁绊与生存展开，描绘了少年少女们在绝望的世界中寻找希望，对抗命运，并最终试图开辟人类与龙共存之未来的壮阔物语。