《陨落星辰》第二季紧接首季结尾，从Tom Mason被外星人掳走三个月后讲起。这段时间里，幸存者队伍失去了核心领袖，士气低落，权力真空导致内部矛盾激化。原本被怀疑的John Pope趁势崛起，暂时接管了指挥权，但他独断专行的作风引发了不少人的不满，反抗军内部暗流涌动。与此同时，Tom在外星母舰上并未坐以待毙。他试图与外星人沟通，向对方解释人类为何即使面对压倒性武力也绝不屈服。这段经历让他对外星人的了解更加深入，也让他意识到这场战争远不止表面那么简单。最终，Tom设法逃回地面，但他的归来却让原本脆弱的权力平衡再次被打破。本季中，反抗军不仅要应对更狡猾、更具攻击性的外星战术，还要面对内部信任的考验。随着新盟友的出现和新敌人的登场，人类生存的希望在绝望与坚持中摇摆。Tom必须重新赢得队伍的信任，并带领大家在残酷的战场上寻找反击的契机，而外星人背后隐藏的真相也正一步步浮出水面。